目前，服务器市场上主流的操作系统就是Windows和Linux系统。海腾数据分别对兼容性、稳定性和费用来区分详细说明。
一、 程序兼容性
如果你的网站很简单，或者只是一个单页网站，那么选择Linux还是Windows都可以。两种主机的而对比主要是针对动态网站，并且是一个完整交互的系统，是需要慎重考虑一下的。因为Linux主机和Windows主机分别支持不同的程序语言和数据库。
Linux服务器作为专业的php网站服务器，一般采用php+linux+apache。对任何PHP、MySQL、Perl开发的网站都是完美适用的，一键安装提供的程序产品更加丰富一些。而Windows主机特有的支持程序应用程序诸如ASP、ASP.Net、 ColdFusion、MSSQL和MS Access Databases，这些是Linux主机无法替代的，同时Windows主机目前也能兼容PHP和MySQL。
二、 性能稳定性
从理论上来说，Linux系统的稳定性强于Windows系统。Linux是多用户多进程系统，windows是单用户伪多用户系统，也就意味着Linux能够一次性处理大量正在运行的进程，比Windows能够处理的数量要多得多。这一点直接降低了Windows系统的稳定性。而且当Windows主机配置变化的时候，通常需要重新启动，这导致不可避免的停机，而Linux通常不需要重启，几乎所有的Linux系统配置的改变都能在系统运行中完成，而且还不会影响其他无关的服务。还有就是Windows主机必须整理碎片，这种操作在Linux主机上少得多。
三、 价格对比
Linux 是免费、开源的，相对于收费的正版Windows系统要便宜很多，所以Linux主机的价格通常都比Windows主机便宜。
实际上，Linux 主机和Windows主机可以说是各有所长。服务器租用提醒您，选择虚拟主机时，第一要考虑网站程序兼容性，其他的两个系统的服务都是差不多的。而在选择 VPS或者独立主机时，由于我们接触的Windows系统更加熟练一些，网站语言兼容的情况下可以优先选择Windows系统。
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